Protein–RNA interactions for Protein: P99024

Tubb5, Tubulin beta-5 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb5P99024 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb5P99024 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb5P99024 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb5P99024 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb5P99024 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb5P99024 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb5P99024 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb5P99024 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb5P99024 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb5P99024 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb5P99024 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb5P99024 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb5P99024 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb5P99024 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb5P99024 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb5P99024 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb5P99024 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb5P99024 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb5P99024 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb5P99024 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb5P99024 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb5P99024 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb5P99024 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb5P99024 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb5P99024 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb5P99024 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb5P99024 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb5P99024 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb5P99024 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb5P99024 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb5P99024 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb5P99024 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb5P99024 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb5P99024 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb5P99024 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb5P99024 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb5P99024 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb5P99024 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb5P99024 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb5P99024 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb5P99024 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb5P99024 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb5P99024 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb5P99024 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb5P99024 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb5P99024 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb5P99024 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb5P99024 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb5P99024 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb5P99024 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb5P99024 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb5P99024 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb5P99024 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb5P99024 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb5P99024 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb5P99024 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb5P99024 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb5P99024 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms