Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc1P98083 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc1P98083 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc1P98083 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc1P98083 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms