Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IhhP97812 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IhhP97812 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IhhP97812 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IhhP97812 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IhhP97812 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IhhP97812 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IhhP97812 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IhhP97812 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IhhP97812 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IhhP97812 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IhhP97812 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IhhP97812 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IhhP97812 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IhhP97812 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IhhP97812 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IhhP97812 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IhhP97812 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IhhP97812 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IhhP97812 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IhhP97812 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IhhP97812 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IhhP97812 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IhhP97812 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IhhP97812 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IhhP97812 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IhhP97812 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IhhP97812 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IhhP97812 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IhhP97812 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IhhP97812 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IhhP97812 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IhhP97812 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IhhP97812 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IhhP97812 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IhhP97812 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IhhP97812 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IhhP97812 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IhhP97812 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IhhP97812 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IhhP97812 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IhhP97812 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IhhP97812 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IhhP97812 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IhhP97812 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IhhP97812 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IhhP97812 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IhhP97812 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IhhP97812 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IhhP97812 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IhhP97812 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IhhP97812 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IhhP97812 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IhhP97812 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IhhP97812 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IhhP97812 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IhhP97812 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IhhP97812 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IhhP97812 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IhhP97812 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IhhP97812 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IhhP97812 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IhhP97812 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IhhP97812 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IhhP97812 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IhhP97812 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IhhP97812 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IhhP97812 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IhhP97812 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IhhP97812 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IhhP97812 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IhhP97812 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IhhP97812 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IhhP97812 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IhhP97812 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IhhP97812 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IhhP97812 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms