Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcc1P97496 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms