Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mesp1P97309 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms