Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H3f3aP84244 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms