Protein–RNA interactions for Protein: P81270

Erg, Transcriptional regulator ERG, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErgP81270 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ErgP81270 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErgP81270 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErgP81270 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErgP81270 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErgP81270 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ErgP81270 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ErgP81270 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ErgP81270 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ErgP81270 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ErgP81270 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ErgP81270 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ErgP81270 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ErgP81270 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ErgP81270 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ErgP81270 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ErgP81270 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ErgP81270 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ErgP81270 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ErgP81270 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ErgP81270 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ErgP81270 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ErgP81270 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ErgP81270 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ErgP81270 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ErgP81270 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErgP81270 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErgP81270 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErgP81270 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErgP81270 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErgP81270 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErgP81270 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErgP81270 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErgP81270 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErgP81270 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErgP81270 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErgP81270 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErgP81270 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErgP81270 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErgP81270 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErgP81270 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErgP81270 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErgP81270 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ErgP81270 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErgP81270 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErgP81270 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErgP81270 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ErgP81270 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErgP81270 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErgP81270 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErgP81270 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErgP81270 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErgP81270 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErgP81270 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErgP81270 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErgP81270 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErgP81270 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ErgP81270 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErgP81270 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErgP81270 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErgP81270 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ErgP81270 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErgP81270 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ErgP81270 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErgP81270 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErgP81270 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErgP81270 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErgP81270 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErgP81270 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErgP81270 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErgP81270 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErgP81270 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErgP81270 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErgP81270 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErgP81270 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErgP81270 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErgP81270 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErgP81270 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErgP81270 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErgP81270 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErgP81270 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ErgP81270 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErgP81270 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErgP81270 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErgP81270 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErgP81270 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErgP81270 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms