Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx1P80205 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx1P80205 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx1P80205 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms