Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf3P70671 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf3P70671 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf3P70671 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf3P70671 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf3P70671 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf3P70671 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms