Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad1P70340 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad1P70340 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad1P70340 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad1P70340 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad1P70340 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad1P70340 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad1P70340 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms