Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad54lP70270 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad54lP70270 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad54lP70270 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad54lP70270 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad54lP70270 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad54lP70270 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad54lP70270 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad54lP70270 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad54lP70270 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms