Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Chl1P70232 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chl1P70232 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chl1P70232 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chl1P70232 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chl1P70232 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chl1P70232 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chl1P70232 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chl1P70232 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chl1P70232 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms