Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DccP70211 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DccP70211 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DccP70211 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DccP70211 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DccP70211 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DccP70211 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DccP70211 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DccP70211 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DccP70211 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DccP70211 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DccP70211 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DccP70211 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DccP70211 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DccP70211 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DccP70211 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DccP70211 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DccP70211 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DccP70211 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DccP70211 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DccP70211 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DccP70211 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DccP70211 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DccP70211 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DccP70211 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DccP70211 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DccP70211 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DccP70211 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DccP70211 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
DccP70211 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DccP70211 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DccP70211 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DccP70211 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DccP70211 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DccP70211 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DccP70211 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DccP70211 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DccP70211 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DccP70211 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DccP70211 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DccP70211 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DccP70211 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DccP70211 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DccP70211 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DccP70211 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DccP70211 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DccP70211 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DccP70211 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DccP70211 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DccP70211 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DccP70211 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DccP70211 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DccP70211 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DccP70211 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DccP70211 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DccP70211 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DccP70211 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DccP70211 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DccP70211 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DccP70211 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DccP70211 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DccP70211 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DccP70211 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DccP70211 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DccP70211 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DccP70211 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DccP70211 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DccP70211 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DccP70211 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DccP70211 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DccP70211 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DccP70211 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DccP70211 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DccP70211 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DccP70211 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DccP70211 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DccP70211 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DccP70211 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DccP70211 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DccP70211 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DccP70211 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DccP70211 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DccP70211 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DccP70211 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DccP70211 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DccP70211 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DccP70211 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DccP70211 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DccP70211 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DccP70211 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DccP70211 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DccP70211 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DccP70211 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DccP70211 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DccP70211 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DccP70211 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DccP70211 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DccP70211 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DccP70211 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DccP70211 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms