Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrig1P70193 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms