Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf5P70191 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf5P70191 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf5P70191 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf5P70191 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf5P70191 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Traf5P70191 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf5P70191 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf5P70191 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf5P70191 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms