Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcbP68404 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcbP68404 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms