Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo1P63166 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo1P63166 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms