Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtnP63089 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtnP63089 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtnP63089 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtnP63089 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtnP63089 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtnP63089 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtnP63089 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtnP63089 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtnP63089 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtnP63089 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtnP63089 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtnP63089 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtnP63089 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtnP63089 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtnP63089 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtnP63089 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtnP63089 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtnP63089 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtnP63089 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtnP63089 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtnP63089 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtnP63089 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PtnP63089 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtnP63089 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtnP63089 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtnP63089 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtnP63089 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtnP63089 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtnP63089 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtnP63089 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtnP63089 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtnP63089 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtnP63089 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtnP63089 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtnP63089 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtnP63089 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtnP63089 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtnP63089 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtnP63089 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtnP63089 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtnP63089 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtnP63089 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtnP63089 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtnP63089 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtnP63089 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtnP63089 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtnP63089 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtnP63089 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtnP63089 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtnP63089 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtnP63089 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtnP63089 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtnP63089 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtnP63089 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtnP63089 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtnP63089 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtnP63089 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtnP63089 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtnP63089 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtnP63089 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtnP63089 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtnP63089 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtnP63089 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtnP63089 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtnP63089 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtnP63089 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtnP63089 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtnP63089 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtnP63089 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PtnP63089 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtnP63089 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtnP63089 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtnP63089 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtnP63089 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.6 ms