Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Crabp1P62965 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms