Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl8P62918 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl8P62918 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms