Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps3P62908 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps3P62908 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps3P62908 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps3P62908 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps3P62908 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms