Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElobP62869 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElobP62869 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElobP62869 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElobP62869 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElobP62869 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElobP62869 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElobP62869 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElobP62869 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElobP62869 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElobP62869 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElobP62869 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElobP62869 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElobP62869 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElobP62869 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElobP62869 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ElobP62869 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElobP62869 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ElobP62869 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ElobP62869 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ElobP62869 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElobP62869 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElobP62869 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElobP62869 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElobP62869 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElobP62869 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms