Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta2P62737 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta2P62737 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta2P62737 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta2P62737 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms