Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou3f4P62515 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms