Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrch1P62046 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms