Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms