Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scarf2P59222 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms