Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm2P58774 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm2P58774 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms