Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Dpf3P58269 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Dpf3P58269 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dpf3P58269 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Dpf3P58269 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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