Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp25P57080 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp25P57080 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp25P57080 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp25P57080 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp25P57080 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp25P57080 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp25P57080 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms