Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sssca1P56873 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms