Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CdaP56389 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CdaP56389 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CdaP56389 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CdaP56389 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CdaP56389 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CdaP56389 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CdaP56389 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CdaP56389 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CdaP56389 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CdaP56389 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CdaP56389 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CdaP56389 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CdaP56389 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CdaP56389 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CdaP56389 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CdaP56389 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CdaP56389 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CdaP56389 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CdaP56389 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CdaP56389 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CdaP56389 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CdaP56389 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CdaP56389 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CdaP56389 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CdaP56389 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CdaP56389 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CdaP56389 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CdaP56389 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CdaP56389 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CdaP56389 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CdaP56389 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CdaP56389 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CdaP56389 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CdaP56389 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CdaP56389 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CdaP56389 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CdaP56389 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CdaP56389 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CdaP56389 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CdaP56389 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms