Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GferP56213 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GferP56213 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GferP56213 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GferP56213 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GferP56213 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GferP56213 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GferP56213 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GferP56213 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GferP56213 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GferP56213 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GferP56213 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GferP56213 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GferP56213 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GferP56213 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GferP56213 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GferP56213 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GferP56213 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GferP56213 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GferP56213 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GferP56213 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GferP56213 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GferP56213 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GferP56213 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GferP56213 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GferP56213 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GferP56213 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GferP56213 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GferP56213 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GferP56213 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GferP56213 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GferP56213 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GferP56213 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GferP56213 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GferP56213 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GferP56213 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GferP56213 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GferP56213 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GferP56213 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GferP56213 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GferP56213 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GferP56213 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GferP56213 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GferP56213 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GferP56213 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GferP56213 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GferP56213 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GferP56213 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GferP56213 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GferP56213 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GferP56213 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GferP56213 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GferP56213 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GferP56213 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GferP56213 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GferP56213 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GferP56213 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GferP56213 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GferP56213 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GferP56213 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms