Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Aqp4P55088 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aqp4P55088 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Aqp4P55088 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Aqp4P55088 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aqp4P55088 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aqp4P55088 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aqp4P55088 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aqp4P55088 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aqp4P55088 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aqp4P55088 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aqp4P55088 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aqp4P55088 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms