Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4aP52963 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4aP52963 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms