Protein–RNA interactions for Protein: P52825

Cpt2, Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt2P52825 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpt2P52825 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpt2P52825 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpt2P52825 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpt2P52825 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpt2P52825 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpt2P52825 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpt2P52825 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpt2P52825 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpt2P52825 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpt2P52825 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpt2P52825 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms