Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e1P52482 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms