Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApodP51910 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApodP51910 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApodP51910 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApodP51910 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApodP51910 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApodP51910 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApodP51910 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApodP51910 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApodP51910 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApodP51910 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApodP51910 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApodP51910 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApodP51910 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApodP51910 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApodP51910 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApodP51910 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApodP51910 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApodP51910 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApodP51910 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApodP51910 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApodP51910 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApodP51910 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApodP51910 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApodP51910 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApodP51910 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApodP51910 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ApodP51910 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApodP51910 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApodP51910 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApodP51910 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApodP51910 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApodP51910 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApodP51910 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApodP51910 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApodP51910 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApodP51910 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApodP51910 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApodP51910 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApodP51910 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApodP51910 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApodP51910 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApodP51910 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApodP51910 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApodP51910 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApodP51910 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ApodP51910 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApodP51910 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApodP51910 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApodP51910 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApodP51910 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApodP51910 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApodP51910 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApodP51910 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApodP51910 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApodP51910 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApodP51910 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApodP51910 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApodP51910 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApodP51910 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ApodP51910 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ApodP51910 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ApodP51910 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ApodP51910 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApodP51910 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApodP51910 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApodP51910 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApodP51910 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApodP51910 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApodP51910 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApodP51910 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApodP51910 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApodP51910 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApodP51910 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApodP51910 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApodP51910 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApodP51910 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ApodP51910 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ApodP51910 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ApodP51910 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApodP51910 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApodP51910 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApodP51910 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApodP51910 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApodP51910 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApodP51910 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms