Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec1P51908 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms