Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TspoP50637 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TspoP50637 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TspoP50637 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TspoP50637 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TspoP50637 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TspoP50637 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TspoP50637 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TspoP50637 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TspoP50637 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TspoP50637 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TspoP50637 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TspoP50637 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TspoP50637 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TspoP50637 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TspoP50637 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TspoP50637 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TspoP50637 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TspoP50637 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TspoP50637 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TspoP50637 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TspoP50637 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TspoP50637 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TspoP50637 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TspoP50637 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TspoP50637 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TspoP50637 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TspoP50637 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TspoP50637 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TspoP50637 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TspoP50637 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TspoP50637 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TspoP50637 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TspoP50637 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TspoP50637 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TspoP50637 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TspoP50637 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TspoP50637 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TspoP50637 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TspoP50637 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TspoP50637 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TspoP50637 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TspoP50637 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TspoP50637 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TspoP50637 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TspoP50637 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TspoP50637 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TspoP50637 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TspoP50637 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TspoP50637 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TspoP50637 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TspoP50637 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TspoP50637 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TspoP50637 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms