Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpdP50404 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpdP50404 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpdP50404 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpdP50404 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpdP50404 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpdP50404 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpdP50404 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SftpdP50404 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SftpdP50404 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SftpdP50404 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms