Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd7P50283 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd7P50283 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd7P50283 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd7P50283 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd7P50283 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd7P50283 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd7P50283 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd7P50283 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd7P50283 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd7P50283 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd7P50283 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd7P50283 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd7P50283 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd7P50283 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms