Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna7P49582 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna7P49582 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms