Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbp3P49194 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbp3P49194 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbp3P49194 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms