Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ercc3P49135 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc3P49135 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms