Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brca1P48754 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca1P48754 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca1P48754 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca1P48754 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brca1P48754 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brca1P48754 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brca1P48754 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca1P48754 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca1P48754 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brca1P48754 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms