Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx1P48377 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms