Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccr7P47774 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr7P47774 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr7P47774 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr7P47774 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr7P47774 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr7P47774 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr7P47774 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr7P47774 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr7P47774 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr7P47774 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr7P47774 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr7P47774 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms