Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrprbP47758 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrprbP47758 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrprbP47758 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrprbP47758 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrprbP47758 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrprbP47758 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrprbP47758 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrprbP47758 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrprbP47758 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrprbP47758 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrprbP47758 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrprbP47758 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SrprbP47758 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SrprbP47758 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrprbP47758 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SrprbP47758 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms