Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnfsf4P43488 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnfsf4P43488 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tnfsf4P43488 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tnfsf4P43488 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tnfsf4P43488 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tnfsf4P43488 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tnfsf4P43488 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnfsf4P43488 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms